如图1表示含有目的基因D的DNA片段长度(bp即碱基对)和部分碱基序列,图2表示一种质粒的结构和部分碱基序列.现有MspⅠ、BamHⅠ、MboⅠ、SmaⅠ4种限制性核酸内切酶切割的碱基序列和酶切位点分别为C↓CGG、G↓GATCC、↓GATC、CCC↓GGG.请回答下列问题:
(1)图1的一条脱氧核苷酸链中相邻两个碱基之间依次由____ 连接.
(2)若用限制酶SmaⅠ完全切割图1中DNA片段,产生的末端是____ 末端,其产物长度为____ .
(3)若图1中虚线方框内的碱基对被T﹣A碱基对替换,那么基因D就突变为基因d.从杂合子分离出图1及其对应的DNA片段,用限制酶SmaⅠ完全切割,产物中共有____ 种不同DNA片段.
(4)若将图2中质粒和目的基因D通过同种限制酶处理后进行,形成重组质粒,那么应选用的限制酶是____ .在导入重组质粒后,为了筛选出含重组质粒的大肠杆菌,一般需要用添加____ 的培养基进行培养.经检测,部分含有重组质粒的大肠杆菌菌株中目的基因D不能正确表达,其最可能的原因是____