位于横断山中的纳帕海属于季节性天然湖泊，湖水从西北角的溶洞泄入地下河，最后注入金沙江。每年6月至次年1月水域面积大，等到次年2月至3月，水域面积急剧缩减，湖底裸露形成大片的沼泽草甸，每年此时纳帕海湖区往往会出现大量死鱼。
