在某基因型为aa的二倍体水稻根尖中，发现一个如下图所示的细胞（图中Ⅰ、Ⅱ表示该细胞中部分染色体，其他染色体均正常），以下分析合理的是（　　）

A：A基因产生的原因可能是其亲代产生配子时发生了基因突变

B：该细胞一定发生了染色体变异，一定没有发生基因自由组合

C：该细胞产生的各项变异均可在光学显微镜下直接进行观察

D：该细胞的Ⅱ染色体有3条，故该细胞中含有3个染色体组