博斯腾湖位于天山山脉南麓焉耆盆地的东南部，是我国最大的内陆淡水湖。全长610千米的开都河是其主要的补给水源，而这座大湖本身又是下游孔雀河的源头。博斯腾湖年均潜在蒸发量可以达到1800毫米，而年均降水量则不足100毫米，因此湖水本身的盐度平衡主要受河流和气候影响来维持。1958年，博斯腾湖湖水的盐度只有0.39克／升，但随后由于开都河流域农田面积的不断扩大，部分河水被引至灌区用于农业生产，灌溉用水又随着河流排入博斯腾湖，这座淡水湖的盐度迅速增高，最高达到接近2克／升，变成了微咸水湖。图甲示意博斯腾湖周边地域(右下小图示意沙漠盐池附近地质剖面)，图乙示意1958～2010年博斯腾湖水位变化。