2018年3月，十三届全国人大一次会议通过的《国务院机构改革和职能转变方案》强调：深化国务院机构改革，要适应新时代中国特色社会主义发展要求，要着眼于转变政府职能，坚决破除制约使市场在资源配置中起决定性作用、更好发挥政府作用的体制机制弊端，围绕推动高质量发展，建设现代化经济体系，着力推进重点领域和关键环节的机构职能优化和调整，建设人民满意的服务型政府。

国务院机构改革坚持一类事项原则上由一个部门统筹、一件事情原则上由一个部门负责；精干设置各级政府部门及其内设机构，科学配置权力，形成自上而下的高效率组织体系。根据改革方案，将环境保护部的职责，国家发展和改革委员会的应对气候变化和减排职责，国土资源部的监督防止地下水污染职责，水利部、农业部、国家海洋局等部门的环境保护职责进行整和组建生态环境部。同时还组建自然资源部、农业农村部等。改革后，国务院正部级机构减少8个，副部级机构减少7个。除国务院办公厅外，国务院设置组成部门为26个。