资料分析：科学家在地层中发现未被在破坏的沉积岩石层的次序，如图，图中Ⅱ层中有物种A的化石，Ⅰ层中有物种B的化石，请据图回答下列问题：  

（1）化石是地层中古代生物的________、遗物和__________。
（2）在研究地层中古生物的结构时发现，越是古老的地层中发掘的生物化石的结构______，越晚期的地层的生物化石结构_______。
（3）关于生物进化问题的研究涉及许多研究方法之一是__________。
（4）试比较物种A与物种B的重要差异：_______________。