玛纳斯河发源于天山北麓，向北注入准噶尔盆地腹地的玛纳斯湖，是下游众多垦区的主要灌溉水源。该河中游山区的肯斯瓦特水利枢纽工程集发电、灌溉、防洪为一体，其设计死水位（允许水库消落的最低水位）海拔955米；高于坝址河床76米，控制灌区（海拔多在500米以下）316万亩。下表为肯斯瓦特断面各月含沙量和输沙量多年平均值统计表。

   桑干河是永定河重要源头，山西境内流域面积占永定河总流域面积40%，近10年永定河主要河段年均干涸121天，生态系统退化严重。2017年6月17日，山西启动桑干河生态补水工程，黄河水经万家寨引黄工程流入桑干河，接着汇入有“北京母亲河”之称的永定河，这是黄河水首次跨流域生态补水。下图示意桑干河水系。